Titoli conseguiti:
Titolo: Dottore di ricerca conseguito il 12/03/2014
Descrizione: Molecular Signal Transduction
Titolo della Tesi: Functional proteomic and biochemical studies on the ABL1 tyrosine kinase and nuclear multiprotein complexes
Voto: conseguito pass with distinction
Nome e indirizzo istituzione: Medizinische Universität Wien - - Vienna

Titolo: Laurea specialistica/magistrale conseguita il 26/05/2008
Descrizione: Genetica e Biologia Molecolare
Voto: 110/110 cum laude
Titolo della Tesi: Role of kinase ATM in the regulation of protein stability
mediated by the protein ligase ITCH
Classe di laurea: 6/S Classe delle lauree specialistiche in biologia
Nome e indirizzo istituzione: Università degli Studi di ROMA "La Sapienza" - P.zza Aldo
Moro, 5 – ROMA

Titolo: Laurea triennale conseguita il 25/07/2005
Descrizione: Scienze Biologiche
Voto: 110/110 cum laude
Titolo della Tesi: Studies of effects COX-independent in the treatment of
epatocarcinoma cells by FANS
Classe di laurea: 12 Classe delle lauree in scienze biologiche
Nome e indirizzo istituzione: Università degli Studi di PALERMO - P.zza della Marina, 61 Pal.
Steri -PALERMO

Esperienze di ricerca:
Periodo: 01/02/2022 - oggi
Posizione: Ricercatore presso Ente di ricerca
Qualifica: Ricercatore
Nome e indirizzo istituzione: Consiglio Nazionale delle Ricerche - Piazzale Aldo Moro, 7 Roma
Struttura: Istituto di Tecnologie Biomediche (ITB) in assegnazione temporanea presso Istituto per la Ricerca ed l’Innovazione Biomedica (IRIB)

Periodo: 01/04/2020 - 31/01/2022
Posizione: Borsista post-doc
Tipo di attività svolta: Post-doctorate research position
Nome e indirizzo istituzione: Istituto Italiano di Tecnologia - IIT - Via Morego 30 - Genova
Struttura Istituto Italiano di Tecnologia

Periodo: 01/04/2017 - 30/03/2020
Posizione: Ricercatore a t.d. presso Ente di ricerca
Tipo di attività svolta: Ricercatore
Nome e indirizzo istituzione: Istituto Europeo di Oncologia (IRCCS) - Via G. Ripamonti, 435
Milano

Periodo: 01/10/2016 - 30/03/2017
Posizione: Borsista post-doc
Tipo di attività svolta: Post-doctorate research position
Nome e indirizzo istituzione: Ospedale San Raffaele S.r.l., Istituto di ricovero e cura a
carattere scientifico (OSR) - Via Olgettina 60 – Milano

Periodo: 01/10/2014 - 30/09/2016
Posizione: Borsista post-doc
Nome e indirizzo istituzione: UNISR - Università Vita Salute San Raffaele - Via Olgettina, 58 -
MILANO
Struttura: Dip. FACOLTA' DI MEDICINA E CHIRURGIA

Periodo: 01/06/2014 - 30/09/2014
Posizione: Borsista post-doc
Tipo di attività svolta: Post-doctorate research position
Nome e indirizzo istituzione: Ospedale San Raffaele S.r.l., Istituto di ricovero e cura a
carattere scientifico (OSR) - Via Olgettina 60 – Milano

Periodo: 14/03/2014 - 30/05/2014
Posizione: Borsista post-doc
Tipo di attività svolta: Post-doctorate research position at CeMM Center for
Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences, Vienna, Austria
Nome e indirizzo istituzione: Austrian Academy of Sciences

Periodo: 01/09/2008 - 12/03/2014
Posizione: Dottorando
Tipo di attività svolta: PhD student at CeMM - Center for Molecular Medicine of the
Austrian Academy of Sciences, Vienna, Austria
Nome e indirizzo istituzione: Medizinische Universität Wien - - Vienna

Periodo: 01/06/2008 - 31/07/2008
Posizione: Borsista
Tipo di attività svolta: Post graduate research fellowship
Nome e indirizzo istituzione: IRCCS - FONDAZIONE SANTA LUCIA - Via Ardeatina, 306 – Roma

Periodo: 01/12/2006 - 26/05/2008
Posizione: Tirocinio
Qualifica: Tirocinante
Tipo di attività svolta: Undergraduate student
Nome e indirizzo istituzione: IRCCS - FONDAZIONE SANTA LUCIA - Via Ardeatina, 306 – Roma

Periodo: 01/09/2005 - 30/11/2006
Posizione: Tirocinio
Qualifica: Tirocinante
Tipo di attività svolta: Undergraduate student
Nome e indirizzo istituzione: Consiglio Nazionale delle Ricerche - Piazzale Aldo Moro, 7
Roma
Struttura: Istituto di biologia e patologia molecolari – IBPM

Periodo: 10/04/2005 - 24/07/2005
Posizione: Tirocinio
Qualifica: Tirocinante
Tipo di attività svolta: Undergraduate student
Nome e indirizzo istituzione: Consiglio Nazionale delle Ricerche - Piazzale Aldo Moro, 7 -
Roma
Struttura: Istituto di Biomedica ed Immunologia Molecolare – IBIM

Premi e riconoscimenti
- Premio/riconoscimento SIBBM Travel Grants (2017).
Assegnato da Italian Society of Biophysics and Molecular Biology per Travel Grant for the participation to EMBO/EMBL Symposium
- Premio/riconoscimento PhD-ITalents (2017).
Assegnato da MIUR, Fondazione CRUI, Confindustria per borsa di ricerca
- Premio/riconoscimento Premio IIM (2015).
Assegnato da IIM Istituto Interuniversitario di Miologia per Best oral presentation
- Premio/riconoscimento COFUND - Marie Curie Incoming Fellowship (2014).
Assegnato da European commission - Académie de Louvain per borsa di ricerca
- Premio/riconoscimento Young Scientist Association (YSA) of the Medical University of Vienna (2011).
Assegnato da YSA Medical University of Vienna per Best oral presentation

Metodologie scientifiche conosciute:
Biologia cellulare. Coltura e crescita di cellule murine, umane e cellule staminali ematopoietiche;
colture e differenziazione di cellule muscolari; trasfezione di linee cellulari;
produzione di vettori virali per l’espressione di proteine esogene in cellule umane;
RNA interference;
saggi di immunofluorescenza e di microscopia ottica; tecniche di sincronizzazione cellulare e analisi cellulari tramite FACS; saggi di luminescena e di fluorescenza.

Biologia Molecolare e biochimica:
Tecniche di clonaggio e di mutagenesi;
PCR e real time PCR; digestioni enzimatiche;
elettroforesi degli acidi nucleici e delle proteine;
trasformazione batterica;
produzione e purificazione di proteine batteriche;
estrazione di acidi nucleici e di proteine dalle cellule;
saggi di purificazione per affinità di acidi nucleici e di proteine;
frazionamenti cellulari; Western Blotting; analisi quantitative di microRNA.

Spettrometria di Massa.
Colorazione Coomassie e Silver staining;
preparazione di campioni sia per gel-based che In-liquid proteomics; frazionamento off-line di peptidi;
immunopurificazione di peptidi; analisi di modifiche post-traduzionali di proteine per proteomica.

Next Generation Sequencing.
Preparazione di library per il sequenziamento Illumina di RNA messageri e di microRNA;
analisi di qualità e quantifica di acidi nucleici pre-sequenziamento; analisi di modifiche post-trascrizionali dell’RNA tramite nanoporedirect RNA sequencing.

Bioinformatica. Programmi del pacchetto Office tra cui Word, Excel, Power Point; il pacchetto Adobe, tra cui Adobe Reader, Adobe Photoshop e Adobe Illustrator;
Cytoscape per la generazione di network di interazione;
PyMol per l’analisi delle strutture di proteine;
MaxQuant e Perseus software per l’analisi dei dati di spettrometria di massa di proteomica;
BioRender per la visualizzazione grafica di schemi e modelli; Reactome e DAVID Gene Ontology per l’analisi funzionale di liste di geni; BioGrid, Intact e String per analisi di interazioni proteina-proteina;
RBPome per l’analisi di interazione proteina-RNA;
CraPome per l’analisi dei dati derivati dalla purificazione per affinità di proteine cellulari.

Altre attività scientifiche
- Insegnamento: Analysis of cellular protein complexes by tandem affinity purification”. FEBS Practical Course on Protein Interaction Modules, September 2-9, 2011, School of Medicine, Split, Croatia
- Insegnamento: Supervisione di studenti di dottorato, di laurea magistrale e laurea triennale
- Associate Editor per Frontiers in Molecular Biosciences –section Protein and RNA Networks
- Ad hoc reviewer di numerose riviste indicizzate tra le quali Frontiers in Molecular Biosciences, STAR Protocols, Journal of Cell Science, Computational and Structural Biotechnology Journal, NAR bioinformatics and genomics, Biology Direct, etc…
- Membro del direttivo dell’Associazione di Biologia Cellulare e del Differenziamento (ABCD)

Il mio principale interesse scientifico è l’identificazione delle interazioni RNA-proteina e proteina-proteina all’interno di cellule di mammifero. Queste interazioni sono essenziali per mantenere la corretta omeostasi cellulare e la loro alterazione e’ connessa con numerose malattie umane, incluse malattie neurodegenerative e cancro. Grazie allo sviluppo di sempre piu’ sensibili approcci di RNA-sequencing e Proteomica è possibile oggi identificare gran parte delle interazioni che avvengono nella cellula, incluse interazioni transienti e fra molecole poco abbondanti. Il mio gruppo di ricerca utilizza la tecnologia di Proximity Ligation basata sull’attivita’ di specifici enzimi derivati dai batteri che permettono di marcare e purificare sia le proteine che gli RNA presenti in prossimita’ (range <20 nm) di una proteina di proprio interesse in cellule vive. In particolare, stiamo sviluppando degli approcci specifici per l’identificazione di RNA interagenti con varie RNA-binding proteins tramite Nanopore RNA Sequencing.

Progetti attivi:
1) PLANS: Proximity Ligation And Nanopore Sequencing for the characterization of native RNA-protein interactions.
Progetto finanziato dall’Unione europea- Next Generation EU, Missione 4
Componente 1, CUP B53D23016490001.

2) Alterations of SACSIN RNA-binding properties are connected to the development of ARSACS.
Progetto finanziato dal Bando Telethon “Seed Grant Fall 2023 ARSACS” in
associazione con la fondazione dei pazienti ARSACS OdV.

• CNR-INVENIT
• ARSACS
• PLANS

• Studio delle interazioni SACSINA – RNA e loro ruolo nello sviluppo dell’ARSACS
• Intervista a Roberto Giambruno a Buongiorno Sicilia